L'allergie est une réaction exagérée ou hypersensible du système immunitaire du corps après une exposition à un allergène. Contrairement à ce que l'on pense, la cause principale de l'allergie aux chiens n'est pas le poil. Les personnes sont allergiques parce qu'elles ont développé une hypersensibilité à une protéine produite par les glandes sébacées et qui se trouve dans la salive, les squames et les écorchures de la peau du chien.
La protéine qui provoque l'allergie est sécrétée par les glandes sébacées et s'adhère aux poils et à la peau. D'autre part, cette protéine se trouve dans sa salive et lorsque le chien lèche ses poils il la dépose sur son pelage. Pendant la période de chute de poils, il disperse ces particules allergènes sur son passage. Voilà pourquoi il est fréquent de croire que c'est le poil qui est la cause des allergies alors qu'en réalité ce sont les particules qui y sont adhérées.
Les chiens renouvellent sans cesse leur peau et perdent des squames microscopiques qui contiennent la protéine. Lors de cette desquamation, les minuscules particules allergènes se dispersent et flottent dans l'air. De la même manière, la chute des poils provoque augmente ce phénomène. Voilà pourquoi un chien qui perd ses poils produira davantage de desquamation et donc une réaction allergique plus importante.